|
Er is 53 Gbp (giga basenparen) DNA gesequenced (53 miljard 774 miljoen en 414 753 duizend oftewel 53,774,414,753, om precies te zijn). Ter vergelijking: 1 humaan genoom heeft 6.3 Gbp DNA, dus er is ongeveer het equivalent van 8 humane genomen gesequenced. De DNA sequenties zijn sinds kerst op de supercomputer aan het 'ontrafelen'
In deze nieuwsbrief probeert Sofie daar een voorstelling van te geven:
“De 'genetische code' van ons DNA bestaat uit 4 'basen' A, T, C, G, en die vormen paren: A-T en C-G. Als je zo’n 6.3 miljard keer ‘ATCTGCGG etc.’ achter elkaar zet, dan heb je ons menselijk genoom. Een bepaalde sequentievolgorde van die 4 letters zijn een functie (bijvoorbeeld een eiwit). Dus als je 54 miljard A, T, C, G achter elkaar zet, dan heb je wat we in oktober 2020 uit het waterstaal hebben gehaald.
Nu is het de bedoeling de volgorde van die letters, ofwel sequenties, te bepalen. Dat gebeurt op de supercomputer, door fragmenten van 150 letters lang, 1 voor 1 met elkaar te vergelijken, te zoeken naar overlap, en als er die is, aan elkaar te hangen zodat we terug een langere streng hebben. Hoe langer de streng, hoe beter we in de databank kunnen opzoeken wat het is”.
Op deze manier komen er uit locatie 13 (Slagmolen/Schabeek/Achterbeek) bijvoorbeeld interessante resultaten naar voren. Dat kun je zien als je een kijkje neemt naar de volgende afbeelding:
|
